EVA-00 : prototype
L'EVA-00 est la première eva qui a été construite. Comme tout prototype, il est très imparfait. Sa synchro est difficile à obtenir, elle ne dispose pas de S2, elle n'a qu'un œil et son armure n'est pas complète au début de la série (elle est orange). Lors du combat contre l'ange Ramiel (ange n°5), elle est sérieusement endommagée et ensuite elle est revêtue d'une nouvelle armure de type B toute bleue.
L'EVA-00 est pilotée par Ayanami Rei. 15 jours avant l'attaque de Sachiel (l'ange n°3), un test de synchro a échoué, l'eva est partie en berserk et Rei a été blessée lors de l’éjection de l'Entry-Plug. Pour contrer le berserk, la NERV utilise de la Bakélite projetée qui emprisonne l'eva. L'EVA-00 sera détruite dans l'épisode 23 quand Rei se sacrifiera. Ses armes sont le canon à positron, la bombe N2 et la lance de Longinus. Contre Ramiel, elle se défendra avec une sorte de bouclier bricolé à partir d'un morceau de vaisseau spatial (du style coque de Space-Shuttle).
L'EVA-00 mène très peu de combat car sa synchro n'est pas très bonne. Il y a deux explications à ça : Ou l'EVA-00 est un prototype instable ou c'est Rei qui est instable (c'est ce qui est suggéré par Ritsuko). En fait, je pencherai plutôt pour la première hypothèse (Lors de l'épisode 14, Shinji teste l'EVA-00 et elle part en berserk dès qu'il pense à Rei).
L'EVA-00 se distingue dans le combat contre Matarael.